Nidovirales

Los Nidovirales son un pedido de virus con multitudes de animales. Incluye a las familias Coronaviridae, Arterivirus y Roniviridae.

Virología

Este grupo consiste en virus que tienen el sentido positivo, genomas del ARN de un solo hilo. Contiene el virus que tiene el genoma del ARN no segmentado conocido más grande, el virus de la hepatitis del ratón (MHV), que tiene un genoma de 31.5 kilobytes. Estos genomas comparten la estructura de mRNA eucariótico, por tanto los virus pueden usar algunas proteínas de la célula del anfitrión durante réplica y expresión génica que ocurre en el cytoplasm de la célula del anfitrión. A diferencia de muchos virus, no tienen polymerase en la partícula del virus, ya que el genoma se puede leer directamente como mRNA cuando primero entra en la célula del anfitrión.

Este grupo de virus expresa las proteínas estructurales por separado de no estructural. Las proteínas estructurales se codifican en la 3’ región del genoma y se expresan de un juego de subgenomic mRNAs. Estos virus codifican un proteinase principal y entre un y tres proteinases accesorios que principalmente se implican en la expresión del gene replicase. Estos proteinases también son responsables de activación o proteínas específicas inactivating en el tiempo correcto en el ciclo vital del virus, así asegure que la réplica ocurra en el momento adecuado. Un gran número de proteínas se ha identificado en los genomas de Nidovirales, pero su función todavía no se ha determinado.

Otras enzimas que pueden estar presentes en el genoma incluyen parecido a papain proembroma, ADP-ribose/poly (ADP-ribose) - encuadernación y/o ADP-ribose 1"-phosphatase actividades y nucleotide cíclico phosphodiesterase.

Mayoría, pero no todos, nidovirus subgenomic RNAs contiene una 5 secuencia del líder ′ sacada a partir del 5 final ′ del ARN genomic.

El frameshift que genera ORF1b frameshift ocurre en un UUUAAAC heptanucleotide secuencia 'deslizadiza' localizada río arriba del ORF1a paran codon y una estructura del pseudonudo del ARN supuesta.

Taxonomía

Este pedido de virus puede ser distinguido de otros virus del ARN por una constelación de siete esferas conservadas - 5 ' TM2 3CLpro TM3 RdRp Zm HEL1 NendoU 3' - con los primeros tres codificados en ORF1a y los cuatro restantes en ORF1b. TM2 y TM3 y esferas transmembrane; RdRp es el ARN polymerase; Zm es un Zn-racimo esfera obligatoria fundida con un helicase (HEL1); 3CLpro es un probromista parecido A 3C; y NendoU es endonuclease uridylate-específico. El 3CLpro tiene un catalítico Su-Cys dyad.

El Nidovirales se puede dividir en dos clades según la talla del genoma: aquellos con genomas grandes (26.3-31.7 kilobases) que incluyó Coronaviridae y Roniviridae (nidoviruses grande) y aquellos con pequeños genomas (pequeño nidoviruses) - un clade que incluye Arteriviridae distantemente relacionado (12.7-15.7 kilobytes). Nidoviruses grandes nidoviruses grandes codifican tanto 2 '-O-methyltransferase como un 3 '-5' exoribonuclease (ExoN) - el ser último muy extraño para un virus del ARN. También codifican a una superfamilia 1 helicase, endonuclease uridylate-específico (una enzima única para nidoviruses) y varios proembroman.

Un virus que pertenece a este grupo - virus de Cavally - se ha aislado de mosquitos. Parece ser sin relaciones con el otro miembro de este pedido y probablemente es el primer miembro de una nueva familia.

Otro virus se ha aislado de mosquitos - virus de Nam Dinh - que parece pertenecer una nueva familia en este pedido.

Otro virus - el virus del besugo blanco - aislado del pescado también puede pertenecer a este pedido.

El virus asociado por la papada y el virus principal amarillo, ambos aislados de gambas, son miembros de este pedido.

Véase también

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